資金調達のために、「農林中央金庫法」に基づいて農林債の発行が認められています。主に機関投資家向けに募集の方法により発行する利付農林債(5年)と財形債を定例発行しています。
農林債の発行残高は、5兆4,216億円(平成22年度末現在)となっており、調達した資金は農林水産業、農林水産業関連企業への融資などに活用されています。